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罗格斯大学蛋白质数据库影响研究、教育和药物发现
时间:2019-10-21 9:37:17 评论:0 收藏本文 复制本页地址 (按Ctrl+D可以收藏到浏览器)

当吉米卡特在2015年被诊断为终末期转移性黑色素瘤时,他开始服用一种部分利用3D分子数据开发的药物。像这些洞察药物发现和其他科学研究领域的见解是可能的,使用14万个以上的三维分子结构,在罗格斯大学-新不伦瑞克省的RCSB蛋白质数据库中免费提供。

如今,这位前总统的癌症已经缓解了,部分原因在于通过了解一种蛋白质的3D结构,这种蛋白质刺激免疫系统攻击并杀死癌细胞,从而开发出抗癌疗法。在生物学中,功能遵循形式,即形状知识(3D结构)解释了蛋白质如何在我们的身体中工作,以及它们如何促进健康和疾病。

“蛋白质数据库通过影响研究、教育和药物发现而改变了生物学和医学,”罗格斯大学教授斯蒂芬·K·伯雷(Stephen K.Burley)和新布伦瑞克罗格斯大学(Rutgers–New Brunswick)的亨利·罗格斯(Henry Rutgers)主席说,他领导了RCSB蛋白质数据库和定量生物医学研究所。它是一种全球公共利益,加速了科学进步。事实上,如果你是一个为蛋白质数据库提供3D结构数据的科学从业者,那么获得诺贝尔化学奖的几率会更高。”

全球唯一的数据库——生物学中第一个开放存取的数字数据资源——由美国、欧洲和亚洲数据中心之间的全球蛋白质数据库伙伴关系管理。美国业务由罗格斯大学和加州大学圣地亚哥分校超级计算机中心领导。资金来自国家科学基金会、美国国立卫生研究院和美国能源部。数据库与罗格斯大学有着悠久的历史。海伦·M·伯曼(Helen M.Berman),Rutgers–New Brunswick的杰出化学和化学生物学名誉教授,于1971年共同创建了数据库,并于1998年将其提交给了Rutgers。她继续在担任名誉董事时提供支持。

相关的Storieswak电子吸引有助于将阿尔茨海默病中发现的淀粉样贝塔片结合在一起,这种淀粉样贝塔片与神经元生长和细胞黏附有关,对疼痛敏感似乎至关重要。复活蛋白质的祖先们将进化洞察其在人类细胞中的作用“几乎每一个方面”。“在任何生物的细胞内发生的兴奋都是由一种蛋白质来完成的,而对这种蛋白质的三维结构的了解告诉了你这种蛋白质是如何工作的,”伯利说。功能是三维形状的直接结果,一旦大自然发现了一种可以作为分子机器工作的策略,它就倾向于在整个进化过程中坚持它。”

每年,超过100万的用户在网上使用RCSB蛋白质数据库资源。他们包括学习基础生物学、生物医学、计算机科学、数学、物理科学、材料科学、生物医学工程、生物能源和可再生能源的人。数据银行的教育和推广网站PDB-101每年吸引60多万用户。

伯雷说:“制药公司和美国食品药品监督管理局也是蛋白质数据库的大用户,因为蛋白质的三维结构能够加速新药物的发现和开发。”蛋白质数据库的使用也有助于对抗抗生素耐药性,这是一个重大的全球公共卫生问题。我们了解到由于数据库中的三维结构,抗生素耐药性是如何在分子和原子水平上发生的。”

根据2017年的一项分析,如果数据库档案消失,我们将损失价值超过130亿美元的宝贵研究数据。RCSB蛋白质数据库服务的经济影响估计每年超过55亿美元,是资源运营成本的800倍。

伯雷说:“这个数字不包括来自生物制药行业的新药的社会效益,生物制药行业负责保存档案的副本,供公司防火墙内的研究人员日常使用。”

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